18 мая 1703 года российская шлюпочная флотилия под командованием Петра I одержала свою первую победу, захватив два шведских корабля в устье Невы. Этот день принято считать датой основания Балтийского флота.

В настоящее время штаб Балтийского флота располагается в Калининграде, помимо этого имеются Балтийская военная база и Ленинградская военная база (Санкт-Петербург, Кронштадт, Ломоносов). Флагман флота - эскадренный миноносец «Настойчивый».

Командующий Балтийским флотом Российской Федерации - вице-адмирал В.П. Кравчук (с 2012 года).